bioSkills

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무엇인가

생물정보학 작업을 수행하는 AI 코딩 에이전트에 도메인 전문 지식을 주입하는 스킬 팩이다. 서열 조작, 변이 호출, 차등 발현, 단일세포 RNA-seq, 경로 분석, 메틸레이션, 집단유전학 등 분석 단계별로 에이전트가 따라야 할 코드 관용구와 모범 사례를 규정한다.

어떻게 동작하나

각 스킬은 SKILL.md 형식의 규칙 파일로 존재하고, 카테고리 단위로 묶여 있다. 설치 스크립트가 해당 파일들을 에이전트의 스킬 디렉터리로 복사하면 에이전트가 작업 중 자동으로 로드해 참조한다. Codex·Antigravity·OpenCode 설치기는 Agent Skills 표준에 맞춰 디렉터리를 변환하며(예: examples/를 scripts/로, usage-guide.md를 references/로), OpenClaw 설치기는 원본 구조를 유지하고 선택적으로 의존성 메타데이터를 덧붙인다.

무엇과 다른가

프롬프트를 매번 직접 작성하거나 단일 CLAUDE.md·AGENTS.md에 규칙을 몰아넣는 방식과 달리, 분석 영역별로 분리된 스킬 단위를 선택 설치한다. --categories로 필요한 영역만 골라 넣을 수 있고, --validate로 규칙 파일 형식을 검사하며, --update로 변경된 스킬만 갱신하고, --uninstall로 bio-* 스킬을 일괄 제거한다.

어떻게 쓰나

설치는 저장소를 클론한 뒤 설치 스크립트를 실행한다. 전역 설치는 ./install-claude.sh, 특정 프로젝트 설치는 ./install-claude.sh --project /path/to/project, 카테고리 지정은 ./install-claude.sh --categories "single-cell,variant-calling" 형태다. --list로 설치 가능한 스킬 목록을 확인한 뒤 첫 작업을 실행하면 된다.

전제와 한계

Claude Code, Codex, Antigravity CLI, OpenCode, OpenClaw에서 동작한다. Python 3.9+와 biopython·pysam·cyvcf2·pybedtools·pyBigWig·scikit-allel·anndata, R/Bioconductor의 DESeq2·edgeR·Seurat·clusterProfiler·methylKit, samtools·bcftools·blast·minimap2·bedtools 등 CLI 도구가 전제된다. 저장소는 아카이브되어 이후 업데이트와 코드 수정이 이루어지지 않으며, 사용자가 직접 분기해 자기 전문성을 규칙에 인코딩하는 방식이 권장된다.

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